組織駐留巨噬細胞（tissue-resident macrophages ，RTMs）幾乎分布于所有的組織。都有自我維持的組織駐留巨噬細胞池。在不同的器官中，長壽的RTMs執行一系列核心職責，以幫助促進體內平衡的器官功能。具體來說，RTMs清除受損細胞或異物，保護神經元突觸，修剪不希望的神經元連接，保護血管系統，并形成抵御入侵病原體的第一道防線的能力。

胚胎來源的組織駐留巨噬細胞（RTM）和循環單核細胞來源的巨噬細胞（mo-mac）存在差異。RTM通過清除損傷細胞和外來物質，預防不必要的炎癥反應。不同部位的RTM具有不同的功能，如腹膜漿膜層RTM偽足包裹促炎碎片，肺泡巨噬細胞清理嗜酸性物質等。RTM具有長壽命且在不同器官中發揮不同的功能，而mo-mac則源自循環單核細胞和炎癥狀態下增生的巨噬細胞。巨噬細胞的來源和功能多樣，這種差異性可能與其所處環境和功能需求密切相關。RTM在維持組織穩態和清除損傷物質方面起重要作用，而mo-mac則主要參與炎癥和免疫反應。深入理解這些巨噬細胞亞群的功能有助于我們更好地了解其在健康和疾病中的作用。

RTM（組織駐留巨噬細胞）在不同組織中扮演著以下基本功能：

1. 維持組織穩態：RTMs有助于保持所在組織的穩定狀態。它們通過清除多余的細胞、促進新的細胞生成和排泄，以及支持血管完整性來實現這一目標。

2. 免疫防御：RTMs是組織的第一道免疫防線。例如，肺泡巨噬細胞在肺部起著即刻的先天免疫防御作用，幫助抵御病原體的侵入。

3. 神經環境調節：小膠質細胞是中樞神經系統中的RTMs，它們在神經血管單位內協同工作，維持神經環境的穩定。它們參與神經元突觸的修剪和清除降解的髓鞘碎片，保持神經系統正常功能。

4. 細胞垃圾處理：RTMs負責吞噬和清除組織中的細胞垃圾和廢棄物，確保組織的正常運作和清潔。

當我們使用荷蘭Liposoma的巨噬細胞清除劑ClodronateLipomes氯膦酸二鈉脂質體清除巨噬細胞時，使用F4/80聯合其他的marker，如CD11b，或者CD11c等時，還可以聯合一些組織駐留巨噬細胞（RTM）的marker，進一步提高研究的顆粒度，細化到某個功能亞群或者空間定位亞群。基于文獻，CX3CR1 是許多駐留巨噬細胞上表達的一個關鍵受體，可以嘗試作為組織駐留巨噬細胞（RTM）的marker。

組織駐留巨噬細胞（tissue-resident macrophages ，RTMs）的一個marker：CX3CR1

在皮膚傷口小鼠模型中，長期的駐留巨噬細胞表達高水平的 CX3CR1，并且通常具有抗炎、促進愈合表型。在腸道中，固有層巨噬細胞是駐留組織巨噬細胞，CX3CR1 陽性的，并參與抗炎功能和維持穩態。此外，在腎臟、肺部、大腦和肝臟等各種組織中，CX3CR1 是駐留巨噬細胞或對組織穩態和免疫調節很重要的特定巨噬細胞亞群的標志性標志物。CX3CR1 的表達有助于區分這些駐留巨噬細胞和通常表達較低水平的募集的炎性單核細胞/巨噬細胞。

如下圖

CX3CR1 differentiates F4/80low monocytes into pro-inflammatory F4/80high macrophages in the liver

趨化因子受體CX3CR1的表達與單核-巨噬細胞系細胞的遷移和信號傳導相關。CX3CR1在肝臟中的具體作用已有研究，CX3CR1在肝巨噬細胞和肝損傷中的作用。肝臟和脾臟的CX3CR1低表達F4/80低表達單核細胞以及CX3CR1低表達CD16?單核細胞在與內皮細胞共培養后被分化為CX3CR1高表達F4/80高表達或CX3CR1高表達CD16+巨噬細胞。此外，人臍靜脈內皮細胞（HUVECs）中CX3CL1缺失可減弱白細胞介素-1β（IL-1β）和腫瘤壞死因子-α（TNF-α）的表達，而重組CX3CL1處理可逆轉共培養單核細胞中的該表達。在氯膦酸鹽脂質體處理后，第2天肝臟F4/80高表達巨噬細胞被成功耗竭，至第4周在CX3CR1 /GFP和CX3CR1GFP/GFP小鼠中恢復，相似的恢復表明其補充替代與CX3CR1無關。然而，CX3CR1 /GFP小鼠的F4/80高表達巨噬細胞顯示出比CX3CR1GFP/GFP小鼠更強的促炎表型。在氯膦酸鹽處理的嵌合體CX3CR1 /GFP和CX3CR1GFP/GFP小鼠中，CX3CR1 F4/80高表達巨噬細胞顯示的IL-1β和TNF-α表達高于CX3CR1?F4/80高表達巨噬細胞。在酒精性肝損傷中，盡管肝臟F4/80高表達巨噬細胞的頻率相似，CX3CR1GFP/GFP小鼠顯示出較少的肝損傷、肝脂肪積累和炎癥反應，相較于CX3CR1 /GFP小鼠。因此，CX3CR1可能成為針對促炎巨噬細胞介導肝損傷的新型治療靶點。