當巨噬細胞在器官組織遇到感染、炎癥，損傷或其他免疫刺激時，它們通常會受到信號的引導，比如趨化因子等，遷徙游走到附近的淋巴結。淋巴結是免疫細胞（尤其T和B細胞）聚集的地方，是免疫應答和免疫細胞互相交流的重要場所。在淋巴結中，巨噬細胞可以與其他免疫細胞如T細胞和B細胞相互作用，以促進抗體產生、細胞免疫和炎癥調節等免疫過程。這種移動和相互作用有助于提高免疫細胞之間的協調性，以更有效地對抗感染和疾病。但是并非所有巨噬細胞都會游走到淋巴結。不同類型的巨噬細胞在體內分布廣泛，有些可能不會進入淋巴結，而是留在特定的組織中（尤其空間結構上定居的巨噬細胞），以執行其特定的免疫功能。巨噬細胞的高度異質性，使得每種巨噬細胞在免疫系統中有其分工的角色和定位，以協同完成免疫應答，從而實現組織的穩態。